1966 Yılında halen 29 Ekim İlköğretim okulu olarak kullanılan binada, Balkiraz Lisesi adı ile öğretime açılan okulumuzun adı veli ve öğrencilerin isteği üzerine Başkent Lisesi olarak değiştirilmiş olup, 1973 yılından bu yana bulunduğumuz binada hizmet vermektedir.
2007-2008 Eğitim Öğretim yılı 2. dönemden itibaren ek bina hizmete girmiş ve 18 adet derslik daha okulumuz bünyesine katılmıştır.2010- 2011 Eğitim Öğretim yılında okulumuz Başkent Anadolu Lisesi´ne dönüştürülmüştür.
2021-2022 Eğitim öğretim yılından itibaren proej okulu olarak hizmet vermektedir.
